十三氟辛基三乙氧基硅烷能被有效应用到大量的商业领域，例如：

文物、砖石的防水防污、防风化保护处理；

混凝土制品的防水斑、白华，防风化处理；

氧化镁及镁矿土制品的防水防污、防反卤处理；

陶瓷、大理石表面防水、防污；

金属（铜、铁、铝等）的表面抗氧化；

天然纤维（羊毛、棉及皮革等）制品的降低抱水性、提高表面憎水防污性整理；

玻璃的表面憎水防污、抗紫外线涂层；

木材及制品的防水防污、防腐蚀处理。

十三氟辛基三乙氧基硅烷的反应性：

本品是一种双官能团化合物，含硅烷氧基官能团在水解后释放低分子醇，由此产生的活泼性硅醇，能与许多无机和有机基材中的羟基、羧基和含氧基团产生化学键合。惰性低表面能的基团，可使被处理过的基材具有极低的表面能和极差的湿润性。

十三氟辛基三乙氧基硅烷的渗透性：

配以合适的溶剂稀释和操作方式，其分子能渗透至坚硬、多空隙的无机结构类基材内达几毫米，从而达到深层次的长期的憎水防污保护。